Beilstein 使用指南-070717.ppt
,Beilstein 使用培训(一) ----化学合成反应的检索,药明康德新药开发有限公司,药明康德版权所有,1,Part I 基本检索方法介绍,2,选择数据库,,3,4,选择绘图工具,,使用较为方面, 一般是默认设置,,5,编辑状态,,选择结构或基团,橡皮,旋转,放大,缩小,,,,,画线,,,,,Clossfire 点击后进入检索页面,6,7,8,最后的字母改为H,代表该结构和氢都可以。 以下几个也是常用的 A任意原子; Q除C,H的原子 M金属原子 X卤素原子 AH, QH, MH, XH则代表这类分子或氢原子,9,10,,11,12,快捷方式打开后某类模板后则成默认方式,要打开其他模板从File工具栏打开,13,14,结构定义状态,,画线将反应物和产物的共同原子连起,,15,在定义状态下,单击反应连线的一端,跳出如右对话框,可设定反应中心反应中心or非反应中心及手性翻转情况(构象翻转or保持),16,,17,使用方法 从ChemDraw中复制结构后,在检索主页面使用Ctrlv 或右键单击后左键点Paste。,Note1. 此法进入编辑器后无效;但可以在主页面复制后再进入编辑器 2. 结构中不能含有ChemDraw自带的模板,不能有任何缩写(无法识别)。,18,,杂原子任意取代 原子任意取代 作为结构检索 作为反应物检索 作为产物检索,,,,,,,19,19,,选择检索反应,点击Start Search后开始检索,,20,Part II 检索技巧介绍,21,结构与官能团分开画,并且都free site可以表示官能团的任意位置取代,代表分子结构中含有吡啶环及硝基,自然就包含了邻、对、间位的硝基吡啶。但有时范围可能过大,包含许多非期望的结构信息,可以通过其他方法加以限定,22,在产物中带有敏感官能团的情况下选择性的反应检索示例,23,24,25,改变键的性质,选择或点击相应的键修改,,,包含所有的芳环结构,再文字定义,包含所有的芳环结构,再文字定义,28,29,,30,,39,Part III 利用 Beilstein 确定合成路线,40,41,设计合成路线(一),42,尽量注意分子具有类似性,这样将其反应条件应用 到我们所要合成的分子中将更可靠. 变换官能团的取代位置,扩展检索范围 非反应的基团相同位置设为Free site 将分子中无关重要的非反应中心为部位变为Free site,设计合成路线(一),43,,,点击反应物,追溯文献合成路线,,,设计合成路线(一),44,设计合成路线(一),45,设计合成路线(二),46,文献中找不到类似结构的合成方法; 相关类似物的合成方法很少,找不到较为合适路线,设计合成路线(二),47,设计合成路线(二),48,设计合成路线(二),49,设计合成路线(二),50,设计合成路线(二),51,设计合成路线(二),设计合成路线(二),53,设计合成路线(二),56,设计合成路线(三),57,Part IV 其他功能介绍,58,将Chemdraw不带缩写的结构复制到CrossFire 检索主页面,点击Autonom键,,59,,输入化学结构后点击“Genernate Name” ,可得到相应的化学结构,其对复杂结构特别带顺反式及多个手性中心的,命名特别方便.其还会标出各种环的各原子的序号.,,,,,选择命名的参考,60,61,Beilstein 带有将检索结果导入到Word的功能,但内容往往太多,阅读不是很方便,因此一般建议使用PrintKey 或 SnagIt来直接复制检索结果.,Question Comments,62,